ПЦР охуительная штука. Но требует неукоснительного соблюдения "производственной гигиены" на всех этапах, от подготовки образов до конца термоциклирования. Это обязательно ламинарные шкафы с биофильтрами и тп дорогая шняга, которой почему-то не во всякой лабе с "ПЦР" есть. Такж важны сами тест-системы. Вопрос, какие именно последовательности будут умножены — ключевой. Есть много разных корон, и они потому и одно семейство, что у них куча одинакового кода (последовательностей). Для создания тест-системы на конкретный тип/подтип нужно выделить его уникальные фрагменты, которые при этом не будут разрушаться в биоматериале и тд тп. Поэтому как раз за месяц разработанные (даже после секвенирования!) тесты вообще не внушают. Они наверняка с ошибками, которые устраняются годами, или хотя бы полугодиями. Через это проходили все тест-системы ПЦР, потому и существуют их разные поколения. Откройте технические подробности ПЦР-тестов на гепатиты, вич и тп и вы увидите, какое поколение тестов. Между поколениями интервалы как раз исчисляются годами — столько нужно, чтобы собрать фидбек по ошибкам (ложноположительные / ложноотрицательные / кривые количественные), проанализировать это, модифицировать тесты на другие наборы последовательностей цепочек РНК/ДНК и выпустить новую версию. Была небольшая надежда, что это можно было бы компенсирвоать кол-вом человекочасов (тупо дохуя бабок свалилось на индустрию, можно больше микробиолухов нанять), но по факту это не сработало.
![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png)
timeasmymeasure
no subject
Date: 2020-11-25 07:58 pm (UTC)Такж важны сами тест-системы. Вопрос, какие именно последовательности будут умножены — ключевой. Есть много разных корон, и они потому и одно семейство, что у них куча одинакового кода (последовательностей). Для создания тест-системы на конкретный тип/подтип нужно выделить его уникальные фрагменты, которые при этом не будут разрушаться в биоматериале и тд тп.
Поэтому как раз за месяц разработанные (даже после секвенирования!) тесты вообще не внушают. Они наверняка с ошибками, которые устраняются годами, или хотя бы полугодиями. Через это проходили все тест-системы ПЦР, потому и существуют их разные поколения. Откройте технические подробности ПЦР-тестов на гепатиты, вич и тп и вы увидите, какое поколение тестов. Между поколениями интервалы как раз исчисляются годами — столько нужно, чтобы собрать фидбек по ошибкам (ложноположительные / ложноотрицательные / кривые количественные), проанализировать это, модифицировать тесты на другие наборы последовательностей цепочек РНК/ДНК и выпустить новую версию.
Была небольшая надежда, что это можно было бы компенсирвоать кол-вом человекочасов (тупо дохуя бабок свалилось на индустрию, можно больше микробиолухов нанять), но по факту это не сработало.